会计师事务所在整个经济发展体系中发挥着鉴证和服务的作用，切实维护着社会公共利益和投资者的合法权益，从而促进社会主义市场经济的健康发展。在新三板中，会计师事务所起着与券商、律师事务所同等重要且必要的作用。

　　对于券商而言，在申请主办券商资格进人新三板时要向证券协会提交最近年度未被注册会计师出具否定意见或者拒绝发表意见的财务报告;在接受拟挂牌企业委托推荐挂牌时，其项目小组成员中至少有1名注册会计师，在内核机构和内核会议中也必须有注册会计师，审核尽职调查的情况，并出具审核意见。

　　对于挂牌企业而言，在其挂牌转让之前，需要披露包括公司财务会计信息的报价转让说明书，为了保证其中的财务会计信息与主办券商出具的推荐报告相一致，挂牌企业往往会委托注册会计师处理;在挂牌转让之后，每年挂牌企业均须披露年度报告，而这份年度报告必须经会计师事务所的审计，对于下半年公司定向增资、公积金转增资本或弥补亏损等的半年度报告也须经注册会计师审计。

　　总体而言，新三板市场需要注册会计师审计并出具相关的报告，也需要注册会计师提供咨询和服务，如协助尽职调查。同样，对于注册会计师或会计师事务所而言，新三板的出台与发展也必然为其提供新的商机。